未来育种的新动力——全基因组选择
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2025-06-17
全基因组选择(Genomic Selection,简称GS)育种是一种利用覆盖全基因组的高密度分子标记进行选择育种的新方法,可通过构建预测模型,根据基因组估计育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)进行早期个体的预测和选择,从而缩短世代间隔,加快育种进程,节约大量成本。全基因组选择(Genomic Selection, GS)正以颠覆性技术重塑育种格局,成为推动农业与畜牧业变革的核心动力。
GS通过覆盖全基因组的高密度分子标记(如SNP),结合机器学习与深度学习模型,直接解码物种的“基因说明书”。例如,在玉米育种中,GS技术可预测64620个杂交组合的产量性状,精准筛选出“优迪899”等突破性品种;在水稻育种中,DeepCCR深度学习模型能预测不同种植地点的表型值,实现“一地一策”精准育种。

传统育种需依赖田间试验,而GS技术仅需少量参考群体的表型数据,即可对候选群体进行基因组育种值(GEBV)预测。例如,在猪育种中,GS技术可在仔猪断奶前获得其基因组育种值,将育种周期缩短50%以上;在奶牛育种中,乳脂产量提升周期从5-8年压缩至2年。
随着基因分型成本降至每样本10美元以下,GS技术已从实验室走向田间。美国先锋种业通过GS优化玉米杂交组合,每公顷增产8%-12%;巴西肉牛养殖企业采用GS选育抗蜱虫种群,每年减少数千万美元兽药支出。
百奥云针对性打造基因型大数据系统,后端采用分布式数据架构,支持储存和管理海量(PB级别)标记和基因型数据。同时,系统拥有专业的群体结构分析与可视化展示工具,包括:遗传距离、PCA、聚类分析、Structure,ADMIXTURE分析等。
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