育种大数据产品

大大提升基因组分析挖掘速度

弹性计算,多快好省

基因云算GenoCompute


GenoCompute是面向系统整合和计算自动化设计,基于命令行和API,支持全球多个公有云的群体基因组计算的基础设施工具。GenoCompute可以轻松地整合到客户现有或未来的业务系统之中,具有无缝连接整个基因组育种平台的能力;能够实现计算监控和机器人告警和通知等功能,提升问题响应能力和效率;数据计算和管理不受区域限制;采用通用基因组工作流标准WDL,降低客户维护、管理和人员交接等计算流程的成本;支持基因组计算关键耗时步骤的GPU加速能力,在大部分基因组上能在成本不变的情况下,获得几十倍的性能加速。

没有最快,只有更快;没有最准,只有更准

 

采用MGISEQ2000测序仪和人类金标准GIAB样本数据,对基于GPU加速的基因组变异检测进行基准测试。基准测试结果表明,与主流标准的GATK相比较,基于GPU的方案在SNP结果上更优,在INDEL结果上一致,完全证明基于GPU加速的方案的准确性。

 

农业动植物基因组测试

 

多个动植物基因组在内的基准测试中,最高基因变异检测 300倍提速达到以上