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2023-08-22
1. 利用PopGenomics快速对基因组实现高质量组装 基因组组装是将全基因组测序的小片段（reads长度100 bp-100 kb）通过算法拼接成尽量长的片段（contig 和scaffold，长度几十kb 到Mb 不等）或者整条染色体的过程。获得包含基因组全序列的参考基因组是对动植物进行基因组学研究和育种利用的前提[1]。 由于植物基因组具有非常丰富的多样性，参考已发表的少数物种组装新的物种，有时却无法达到理想的组装效果。测序技术发展提供了短序列测序、单分子测序、光学图谱、Hi-C 图谱等多种测序技术及其组合的组装方案，到目前为止，已经有上千个植物基因组被组装（图1）。然而，如何以最低成本快速获得满足需求的高质量基因组，仍然是科研人员和育种数据分析人员普遍面临的一个问题。
2023-07-28
水满田畴稻叶齐，一辆辆满载宾客的小车驶入稻田深处，7月21日的隆平稻作公园似乎格外热闹。由湖南省种子协会、水稻智能育种联盟与百奥云联合举办的水稻智能育种技术协同研讨会在此召开，来自广东农科院水稻所资源室的李晨研究员一行显得格外气定神闲，他们带着479份广东籼稻种质资源材料信息远赴长沙，要在这里与佳和种业进行“种质交换”。