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飞过无人机后怎么办？-张志武教授做客百博智慧讲堂精彩回放

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2020-05-16 00:00

　　张志武教授简介

　　张志武教授，任教于华盛顿州立大学作物与土壤科学系，主讲统计基因组学，科学研究致力创新统计方法和计算工具，继而推动人类疾病的攻克和加速动植物基因组的遗传改良。张志武教授担任两大通用计算机软件TASSEL和GAPIT的作者和设计者，研究成果发表于Nature Genetics、Briefings in Bioinformatics和Plant Cell等著名学术期刊，文章被引用超万次。张志武教授承担多项美国联邦研究项目主持人，其中包括应用无人机与卫星遥感以及人工智能的植物育种。张志武教授亦担任美国农业部、加拿大农业部、英国生物科学技术委员会(BBSRC)、瑞士国家科学基金和中国国家自然基金项目评审人。自2015年起，被华盛顿州谷物协会授予统计基因组学杰出教授，享受特殊津贴。

　　Q：1、无人机图像得到的dsm是用pix4d进行做差的吗?

　　Answer: Pix4d 可以分别输出DSM和DTM这两个结果。如果要用这两个结果进行运算比如相减，可以使用开源的QGIS软件进行做差计算 (The answer was provided by ZhouTang: http://zzlab.net/zhoutang)

　　Q：2、您觉得未来GS的发展方向是什么，现在有哪些挑战?

　　Answer: It may go back to itsorigin, marker assisted selection with sufficient sample size and markerdensity.

　　Q：3、我在采集无人机作物光谱图像后，需要获得作物高度，但是在之前没有采集dem，所以没办法做相减，请问我现在应该如果提取高度数据。

　　Answer: 最简单的办法是Pix4d软件，它能从无人机图像中提取出DEM，包括DSM和DTM。不需要额外去采集DEM (The answer wasprovided by Zhou Tang: http://zzlab.net/zhoutang)

　　Q：4、GWAS和表型参数之间有什么关联?您怎么看二者关系。

　　Answer: Sorry, unclear which 表型参数 (heritability, average, variation?).I will be glad to make comments for a specific parameter.

　　Q：5、请问在评价canopy area与biomass的相关性时，canopy area的分割精度如何?我们发现直接对无人机影像的图像分割往往存在较大的误差呢。

　　Answer: Sorry, not evaluation yetexcept prediction accuracy.

　　Q：6、如果我把种子，固定可以种子的坐标和种子的表型一一对应吗?

　　Answer: Yes

　　Q：7、能否做peanut的地下产量的表型?

　　Answer: It is challenge.

　　Q：8、无人机在检测果树果实品质和病虫害方面是否有所应用?

　　Answer: Great potential.

　　Q：9、GEBV是否可以作为表型值，做GWAS分析?然后，ssGBLUP或ssGWAS是否在张老师开放的软件中实现?

　　Answer: GEBV can be used asdependent variables. Single step approach is under consideration by the currentleading author of GAPIT 3, Jiabo Wang (Email: wangjiaboyifeng@163.com).

　　Q：10、请问通过dsm测的作物株高是小区的平均株高还是能做到测单株株高?株高的真实值是小区的平均株高吗，因为小区的每株的株高参差不齐，怎么确定真实值?

　　Answer: This depends on ifindividual plants can be segmented individually. If not, Plot averages are thebest estimates.

　　Q：11、无人机图像得到的dsm是用pix4d进行做差的吗?

　　Answer: Yes

　　Q：12、grid软件在哪里可以下载?

　　Answer: http://zzlab.net/GRID

　　Q：13、张老师您在处理苜蓿的多幅图像时，运行您自己的处理软件，以及pix4D软件时，需要什么性能的计算机呢?谢谢

　　Answer: Most of the softwarepackages by Zhiwu Zhang Lab (http://zzlab.net)apply to super computer and regular computers, such as desktop or laptop. Adesktop is recommended PIX4D. 用于拼接的的电脑最低64G内存，可以同时跑2到3个项目。CPU的型号不是很确定，当前主流的CPU(i5， i7)应该都可以。然后一个项目的输出结果通常都有十几，二十多G，所以要留出足够的硬盘空间 (Theanswer was provided by Zhou Tang: http://zzlab.net/zhoutang).

　　Q：14、GS应用时如何解决过度拟合的问题?

　　Answer: Use a validate testingpopulation.

　　Q：15、目前提取无人机图像的纹理信息，有什么比较好的方法或者算法吗?

　　Answer: Sorry, no experiencesyet.

　　Q：16、分析软件有mac版的吗?叫什么名字?

　　Answer: Pix4D有mac版，但是功能不全。Windows版本是最全最新的 (The answer was provided by ZhouTang: http://zzlab.net/zhoutang).

　　Q：17、GRID做小区分割的示例，小区间有明显的隔离区没有种植，如果没有隔离种植的小区能自动分割吗?

　　Answer: 如果没有隔离种植，但是人眼可以看出小区间的差别，GRID可以帮助使用者手动的去调节行与列的分割格子(The answer was provided byZhou Tang: http://zzlab.net/zhoutang).

　　Q：18、实际大田试验中地形变化是对作物信息提取的最大干扰，在图像处理中您如何处理这个问题呢?谢谢!

　　Answer: Spatial regression

　　Q：19、请问无人机测表型的时候，能获得叶片的具体性状么?比如叶面积，形态等

　　Answer: Sorry, no experiencesyet.