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百奥云发布智能育种平台

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百奥云发布智能育种平台

—大数据时代下的育种数据管理和分析软件

 

随着高通量自动化技术应用,育种将产生大量的表型和基因型数据,未来育种决策将越来越多的依赖数据分析,并减少对经验的依赖。对育种数据的管理会成为我国种业公司的新基建项目,而对数据的分析挖掘能力将成为育种的核心竞争力。

百奥云立足育种前沿领域,2018年推出育种表型数据分析系统,2019年推出基于微信的田间采集小程序百奥e。今天百奥云正式发布全新的基因型大数据系统,并升级表型数据分析系统和百奥e采。三款产品间的数据连通,形成了一套集育种数据采、管、算为一体的百奥云智能育种平台

 

何为采?

         —百奥e

采,即为对育种数据的采集。

田间数据采集手工记录,方式落后,效率低。手工采集,很难保证及时的数据汇总工作,增大了育种工作管理难度。我国目前的育种工作,大多停留在田间手工记录在本子上的阶段,这就产生二次数据整理和录入工作易出错、数据整理工作量大、数据采集滞后等问题。甚至出现历史育种数据成为垃圾数据的糟糕局面。数据报不上来,数据分析利用、制订下一步育种计划都要受影响。因此,育种工作需要配备高效数据采集软件或设备。

百奥云开发的两款田间数据采集小程序百奥e百奥e采(高级版),实现了田间数据手机记录,一步实现数据集中汇总。

百奥e

1、用户无需安装APP和其它育种软件,打开微信小程序就可以采集;

2、占用手机空间和内存都少,采集速度快;

3、根据不同数据类型设计的采集界面,简洁易用;

4、内置多种作物性状定义及采集规范;

5、可实时校验汇总数据,采集完成后可立即下载为Excel数据,防止数据丢失;

6、无需事先设置采集任务,可根据田间行列数临时生成,随时开始采集;

7、图片采集便捷,新增水印功能,易于查看;

8、免费使用!

 

百奥e采(高级版)

1、在基础版功能上实现与百奥云表型数据系统对接,采集任务自动下发,数据无缝传接;

2、数据也可上传至用户指定的服务器,数据存储无忧;

3、适合大客户使用,可定制界面和数据接口。

 

何为管?

“育种数据管理第一重要”

管,即为对育种数据的管理。

伴随高通量表现型分型技术和高通量基因分型技术的迅猛发展,对海量数据进行采集、加工处理、分析统计、可视化和最终应用于育种决策过程已经成为时代的标志,精确育种正式迎来了大数据时代。几千个育种材料,每个材料有上万个基因型位点,就是几千万到上亿条数据,不仅Excel处理不了,常用的关系型数据库也很难驾驭。没有先进的育种数据管理系统,很难实现现代商业育种。

表型数据管理

百奥云智能育种系统中的表型数据管理模块,可通过Excel将记录的表型数据导入系统中,同时也可从指定的数据库系统自动获取数据,实现数据整合。

基因型数据管理

百奥云智能育种系统中的基因型数据管理模块,采用分布式数据库架构,可以轻松管理和可视化基因型数据。

SNP位点管理

基因型管理

何为算?

算,即为对育种数据的分析计算。

数据快速积累的同时,如果没有大数据分析技术,数据将会变得十分庞大和复杂。数据本身并不能创造价值,只有通过有效的数据分析,为解析生物学数据与目标农艺性状的关系提供信息,才能帮助种育种家做出有效决策。现代育种技术体系复杂,需要多个学科交叉和多技术支撑。随着大量表型数据与基因型数据的积累,传统的数据分析模式已不能满足当下需求。百奥云开发的智能育种平台,涵盖了表型和基因型数据分析的常用功能。百奥云还可为用户提供定制化的全基因组预测和选择分析服务。

表型数据分析

表型数据分析功能中,不仅包含多种常规分析(如方差分析、回归分析、显著性分析等),还有深入分析功能。比如针对原始数据误差较大的问题,采用空间校正方法来减少环境不均一带来的误差。除空间校正外,还应用混合线性模型来估算品种的育种值,从而判断育种材料之间真正的遗传差异。还可以整合系统内多年的历史数据进行分析,对育种和决策比较有帮助。比如性状稳定性分析, 可用于比较两个品种在历年来的表现。也可进行区域适应性分析,对于品种定位非常有帮助。田间热力图,可用来直观展示试验田中不同小区之间产量的差异,从而反应出整块田的肥水管理是否均匀一致。这些分析模块是一般的育种软件所不具备的。分析结果以可视化的方式展示,同样的表格数据,我们会尽可能用图形来表达,例如柱形图、折线图、K线图、箱线图等。

百奥云表型数据系统的分析功能此前有过详细介绍,请点击百奥云—智能育种数据平台查看。

基因型数据分析

基因型数据分析模块内置常用的基因型分析工具,如遗传距离计算、聚类分析、群体结构分析、PCA分析,基因型比较等等,用户只要点击几下鼠标就可以轻松完成专业的基因型数据分析工作,辅之以可视化图形展示,结果一目了然。

百奥云的育种软件系列产品已在隆平高科、湖南杂交水稻研究中心、河北农科院等几十家育种企业和科研单位使用。百奥云领先的设计、完善的功能、易用的界面和贴心的服务,受到了用户的广泛好评。此次百奥云发布智能育种平台,将育种数据采集和管理及基因型与表型数据的分析融为一体,在智能育种的道路上迈出了坚实的一步。


百奥云智能育种引领者!

 

联系方式

 

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2020年7月17日
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