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GENOTYPE
基因型大数据系统
背景
随着测序检测成本不断下降，未来检测一个材料的基因型将比检测其表型更便宜，可以预料将会产生海量的基因型数据。商业化育种项目每年都培育几千个新材料，每个材料均包含几万个基因型位点，因此每年都将产生几千万乃至上亿条数据，常规的关系型数据库恐难以有效管理海量基因型数据。百奥云针对性打造基因型大数据系统，支持储存和管理海量（PB级别）标记和基因型数据。
产品简介
SNP标记广泛应用于植物遗传图谱构建、全基因组关联分析、基因多样性研究、种质鉴定和品种识别，全基因预测等多个领域。百奥云基因型大数据系统后端采用分布式数据架构，支持储存和管理海量(PB级别)标记和基因型数据。
系统内置常用基因型分析工具，轻松完成专业的生物信息分析工作，可以在整合SNP位点信息、材料信息、基因型数据的管理、比较材料之间的差异，品种真实性鉴定、目标基因检测、定向改良、基因聚合、回交育种等方面发挥作用。同时，系统拥有专业的群体结构分析与可视化展示工具，包括：遗传距离、PCA、聚类分析、Structure，ADMIXTURE分析等。
产品特点
- 更海量 基于大数据集群分布式储存，可存储百亿级SNP基因型数据，高扩展、高可靠、高性能。
- 更快速秒级快速检索，轻松查看制定区间的基因型，检索速度不会随着数据量增加而变慢。
- 更专业整合公共库资源，有效进行品种比较。整合专业生信分析工具，在育种中提高目标范围及设计深度。
- 更前沿系统整合全基因组预测模块，进行更专业的模型预测，还可管理分析不同物种的基因型数据及同一物种下多参考基因组版本的数据。
产品功能
海量数据管理
真实性鉴定
近似品种鉴定
目标基因检测
进化树
遗传距离
PCA分析
ADMIXTURE分析
应用案例
